畜禽粪便加入后，当温度、水分、氧含量等条件达到一定指标时，这些微生物大量繁殖并分解畜禽粪便中含有的有机物。不溶性大分子有机物先附着在微生物外，由微生物所分泌的胞外酶分解为可溶性小分子物质，再送入微生物细胞内被利用，而堆体基质的形态复杂，只有分解为简单形态才能为微生物利用。畜禽粪便的高温好氧发酵过程实际上就是畜禽粪便中的微生物发酵的过程。
高温好氧发酵罐的优势介绍
好氧发酵罐和普通有机肥生产设备的对比 1，时间上:好氧发酵罐发酵时间为8-10个小时;发酵塔发酵时间为7天。 2，占地面积上，好氧发酵罐和有机肥发酵塔占地面积相差不多，发酵塔占地面积稍大，控制污染的臭气稍难。 3，设备投资上:发酵塔投资较发酵罐投资大一些，有机肥好氧发酵罐相对节约成本 4，效率上:该发酵罐效率较高，一个20吨的发酵罐，操作比较容易，易于管理，设备运转平稳，一天可以发酵48吨有机肥;有机肥发酵塔，如果一天发酵48吨，那么一组发酵塔投资就比较大了，保温性能也不及高温好氧发酵罐。 5，发酵效果:好氧发酵罐实用的菌种为高温菌种;发酵塔使用的是传统的菌种。两种发酵的肥料效果相同，都可以达到分解有机物的目的。
高温好氧发酵罐工艺运行基本条件
(1)有机物含量：含量≥20％。
(2)含水率：含水率应维持在50％～65％之间。
(3)温度要维持在50～65℃之间，其中保持55℃以上的时间要超过5天。
(4)碳氮比(C／N)：(20～30)：1。
(5)pH值控制在7～8．5之间。
(6)通风量：3．0～3．6m3／(m3污泥·h)。
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